犬流感病毒的分子生物学检测与hana序列遗传进化分析
犬流感是近十年新发现的传染病，为了解2017年冬季上海临床接诊的犬中，犬流感病毒感染情况和病毒变异趋势，本研究对上海某动物医院2017年冬季犬流感病毒进行监测，对疑似犬流感样品进行RT-PCR检测，构建HA、NA的重组载体并测序，对获得的序列进行进化分析、氨基酸变异分析，综合我国同亚型犬流感HA序列进行进化率分析。从23份疑似样品中检出5份阳性样品，获得5个H3亚型的HA节段序列、2个N2亚型的NA节段序列，上述序列在进化树中已经形成独立的进化分支，与韩国、广东毒株亲缘关系最近。氨基酸比对表明，HA和NA在重要位点发生许多一致的突变，如抗原位点区域、糖基化位点等，NA茎部未见氨基酸插入。对2007年至2017年中国南方地区分离的H3N2犬流感病毒HA节段进行进化率、变异率分析，结果显示年平均进化率呈逐年增高趋势，变异不断积累。因此，开展犬流感病毒变异监测，掌握病毒变异和进化方向，对防控该病、防止病毒向人群传播有重要意义。
目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言（或绪论）1
1 材料与方法2
1.1 材料 2
1.2 方法 2
1.2.1 病料的采集与处理2
1.2.2 病毒RNA的提取2
1.2.3 病毒RNA的反转录3
1.2.4 PCR检测3
1.2.5 HA和NA全基因扩增3
1.2.6 目的片段克隆载体的构建与测序3
1.2.7 系统进化分析与位点变异分析3
1.2.8 变异率与进化率分析3
2 结果3
2.1 犬流感病毒的检测3
2.2 HA和NA全基因序列4
2.3 HA和NA序列系统进化分析4
2.4 HA基因核苷酸进化率分析5
2.5 HA、NA基因推导氨基酸位点分析6
3 讨论7
致谢8
参考文献9
犬流感病毒的分子生物学检测与HA、NA序列遗传进化分析
金善宝动物实验班 范玉凤
目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言（或绪论）1
1 材料与方法2
1.1 材料 2
1.2 方法 2
1.2.1 病料的采集与处理2
1.2.2 病毒RNA的提取2
1.2.3 病毒RNA的反转录3
1.2.4 PCR检测3
1.2.5 HA和NA全基因扩增3
1.2.6 目的片段克隆载体的构建与测序3
1.2.7 系统进化分析与位点变异分析3
1.2.8 变异率与进化率分析3
2 结果3
2.1 犬流感病毒的检测3
2.2 HA和NA全基因序列4
2.3 HA和NA序列系统进化分析4
2.4 HA基因核苷酸进化率分析5
2.5 HA、NA基因推导氨基酸位点分析6
3 讨论7
致谢8
参考文献9
犬流感病毒的分子生物学检测与HA、NA序列遗传进化分析
金善宝动物实验班 范玉凤
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