多重实时荧光pcr检测血旺中鸭,猪和鸡血液成分
摘要:本实验建立了准确可靠的多重TaqMan实时荧光PCR方法用于鉴别血旺中鸡,鸭和猪血液成分。该方法基于动物细胞核DNA中的特异性位点设计引物和探针,进行实时荧光定量PCR扩增,对自制样本和市售样本进行检测,结果表明其特异性好,各物种的最低检测限为0.15ng,灵敏度达1%。可实现对血旺中三种动物血液成分的鉴别。
目录
摘要3
关键词3
Abstract3
Key words3
引言3
1材料与方法4
1.1材料与试剂 4
1.1.1材料 4
1.2仪器与设备4
1.3实验方法4
1.3.1模板DNA的制备4
1.3.2血旺样品的制备5
1.3.3引物与探针的合成5
1.3.4多重TaqMan探针实时荧光定量PCR法特异性分析7
1.3.5多重TaqMan探针实时荧光定量PCR法的检测限和灵敏度分析 Y
1.3.6验证实验和抽样检测7
2结果分析7
2.1样品总DNA的提取7
2.2多重TaqMan探针实时荧光定量PCR法的特异性分析 8
2.3多重TaqMan探针实时荧光定量PCR法的检测限和灵敏度分析 9
2.4多重TaqMan探针实时荧光定量PCR法的验证试验和抽样检测 11
3讨论13
致谢13
参考文献13
多重实时荧光PCR检测血旺中鸭,猪和鸡血液成分
引言
引言
肉的掺假一直是社会关注的热点,而发展快速有效的助手鉴定技术是解决关键。自从Tartaglia[1]等首先报道了用 PCR 方法检测饲料中的牛、羊源性成分至今,以PCR为基础的技术已逐步成为了肉类种属鉴定的主要方法[25]。其中,常规PCR[6]技术指在PCR反应基本组成成分基础上发生聚合酶链反应的技术,同一体系内只有一对引物和单一目的模板,操作简单、快速相比于荧光定量PCR法,对设备要求不高,成本更低廉;多重PCR[7]指在传统的常规PCR基础上,于同一体系中加入多对特异性引物,对多个
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DNA模板或同一模板的不同区域扩增出多个目的片段,由于多重PCR能够实现同时扩增多个目标基因,并且扩增产物是由于自己片段大小不一,通过琼脂糖凝胶电泳进行区分,具有降低成本、提高效率、节省时间的优点;限制性片段长度多态性PCR技术[8],即PCRRFLP,是PCR技术和RFLP技术联合应用。该方法通过设计适当的引物,扩增一段含有特定限制性内切酶酶切位点的DNA片段,经酶切和琼脂糖凝胶电泳,得到特异性的条带,以鉴别不同基因型;随机扩增多态性PCR,即RAPDPCR,是RAPD技术与PCR技术的联合应用。该技术以PCR技术为基础,设计一系列(通常数百个)互不相同的随机排列碱基顺序的寡核苷酸单链(通常为10聚体)为引物,对目的基因片段进行PCR扩增,聚丙烯酰胺或琼脂糖电泳分离,经EB染色或放射自显影来检测PCR产物,以观察DNA片段的多态性;实时荧光定量PCR技术[9]是在常规PCR反应体系中加入荧光基团,根据荧光信号的强度,利用标准曲线、Ct值等对未知模板进行定量分析的方法。
近年来,实时荧光PCR技术是研究热点,其中TaqMan探针技术和SYBR GreenⅠ染料技术应用最为广泛。前者的原理是根据在PCR扩增时,荧光标记探针被降解,发出荧光信号,实现了荧光信号的累积与PCR产物的形成的完全同步,通过监测系统来定量;后者的原理是于SYBR荧光染料特异性地插入到DNA双链之后发射荧光信号,使得荧光信号与PCR产物同步增加,同样通过荧光监测系统来定量。荧光定量PCR技术可以在定性的基础上,达到定量检测的要求。与其他PCR方法相比,在PCR技术的高特异性、高灵敏度的基础上,同时做出定量检测,简便可靠,是鉴别肉类的实用技术。由于PCR反应及其敏感,会受到残留的DNA提取试剂和加工原料的影响,因此要特别注意防止实验的假阴性,在体系中加入一条扩增内标是有效手段,何玮玲[10]等建立含有扩增内标(IAC,Internal amplification control)的用于食品中猪肉和鸡肉成分鉴别的 Taqman 探针实时荧光 PCR 检测方法,结果显示含有扩增内标的 Taqman 探针实时荧光 PCR 体系能有效地进行食品中猪肉和鸡肉成分的快速检测,非目标物种在 40 个循环内均无出现扩增,检出限均为 0.5 ng DNA;该体系对鲜肉和熟肉来源的 DNA 模板检测无显著差异;对市售食品样本的鉴别验证了方法的实用价值。
本实验中,我们把多重PCR和实时荧光PCR结合起来,以猪的细胞核基因βactin 基因(beta actin gene),鸡的细胞核基因转化生长因子基因(transforming growth factor gene)和鸭的白细胞介素2 mRNA基因(interleukin2 mRNA gene)为靶序列,建立了用于鉴别血旺中猪鸡鸭三种动物血液成分的多重实时荧光PCR方法,可实现对三个物种的同时鉴别。
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
1.1.1 材料
新鲜鸡血,鸭血采自农贸市场,新鲜猪血采自屠宰场。驴肉、牛肉、兔肉、鹅肉、鱼、山羊肉、绵羊肉、均购于南京超市,用前均储存在-20℃冰箱。
1.1.2 试剂
酚氯仿方法所用主要试剂:自制STE(0.1mol/LNacl+10mmol/LTrisHCL、pH8.0+1mmol/L EDTA);SDS(20%);Tris饱和酚;Tris饱和酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1);氯仿∶异戊醇(24∶1);无水乙醇;NaAc(pH=5.2);70%乙醇;洗脱剂TE。
血液基因组DNA提取试剂盒(DP318) 天根生化科技(北京)有限公司;
血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒(DP304) 天根生化科技(北京)有限公司;
植物基因组DNA提取试剂盒 天根生化科技(北京)有限公司;
Premix Ex Taq 宝生物工程(大连)有限公司;
引物和探针合成、人工全基因合成 上海辉睿生物科技有限公司完成;
1.2 仪器与设备
MLX206迷你离心机 美国Crystal公司;
TG16WS台式高速离心机 湖南湘仪实验室仪器开发有限公司;
MB102恒温振荡金属浴 杭州博日科技有限公司;
NanoDrop2000微量核酸蛋白分析仪 美国热电公司;
目录
摘要3
关键词3
Abstract3
Key words3
引言3
1材料与方法4
1.1材料与试剂 4
1.1.1材料 4
1.2仪器与设备4
1.3实验方法4
1.3.1模板DNA的制备4
1.3.2血旺样品的制备5
1.3.3引物与探针的合成5
1.3.4多重TaqMan探针实时荧光定量PCR法特异性分析7
1.3.5多重TaqMan探针实时荧光定量PCR法的检测限和灵敏度分析 Y
1.3.6验证实验和抽样检测7
2结果分析7
2.1样品总DNA的提取7
2.2多重TaqMan探针实时荧光定量PCR法的特异性分析 8
2.3多重TaqMan探针实时荧光定量PCR法的检测限和灵敏度分析 9
2.4多重TaqMan探针实时荧光定量PCR法的验证试验和抽样检测 11
3讨论13
致谢13
参考文献13
多重实时荧光PCR检测血旺中鸭,猪和鸡血液成分
引言
引言
肉的掺假一直是社会关注的热点,而发展快速有效的助手鉴定技术是解决关键。自从Tartaglia[1]等首先报道了用 PCR 方法检测饲料中的牛、羊源性成分至今,以PCR为基础的技术已逐步成为了肉类种属鉴定的主要方法[25]。其中,常规PCR[6]技术指在PCR反应基本组成成分基础上发生聚合酶链反应的技术,同一体系内只有一对引物和单一目的模板,操作简单、快速相比于荧光定量PCR法,对设备要求不高,成本更低廉;多重PCR[7]指在传统的常规PCR基础上,于同一体系中加入多对特异性引物,对多个
*好棒文|www.hbsrm.com +Q: ¥3^5`1^9`1^6^0`7^2$
DNA模板或同一模板的不同区域扩增出多个目的片段,由于多重PCR能够实现同时扩增多个目标基因,并且扩增产物是由于自己片段大小不一,通过琼脂糖凝胶电泳进行区分,具有降低成本、提高效率、节省时间的优点;限制性片段长度多态性PCR技术[8],即PCRRFLP,是PCR技术和RFLP技术联合应用。该方法通过设计适当的引物,扩增一段含有特定限制性内切酶酶切位点的DNA片段,经酶切和琼脂糖凝胶电泳,得到特异性的条带,以鉴别不同基因型;随机扩增多态性PCR,即RAPDPCR,是RAPD技术与PCR技术的联合应用。该技术以PCR技术为基础,设计一系列(通常数百个)互不相同的随机排列碱基顺序的寡核苷酸单链(通常为10聚体)为引物,对目的基因片段进行PCR扩增,聚丙烯酰胺或琼脂糖电泳分离,经EB染色或放射自显影来检测PCR产物,以观察DNA片段的多态性;实时荧光定量PCR技术[9]是在常规PCR反应体系中加入荧光基团,根据荧光信号的强度,利用标准曲线、Ct值等对未知模板进行定量分析的方法。
近年来,实时荧光PCR技术是研究热点,其中TaqMan探针技术和SYBR GreenⅠ染料技术应用最为广泛。前者的原理是根据在PCR扩增时,荧光标记探针被降解,发出荧光信号,实现了荧光信号的累积与PCR产物的形成的完全同步,通过监测系统来定量;后者的原理是于SYBR荧光染料特异性地插入到DNA双链之后发射荧光信号,使得荧光信号与PCR产物同步增加,同样通过荧光监测系统来定量。荧光定量PCR技术可以在定性的基础上,达到定量检测的要求。与其他PCR方法相比,在PCR技术的高特异性、高灵敏度的基础上,同时做出定量检测,简便可靠,是鉴别肉类的实用技术。由于PCR反应及其敏感,会受到残留的DNA提取试剂和加工原料的影响,因此要特别注意防止实验的假阴性,在体系中加入一条扩增内标是有效手段,何玮玲[10]等建立含有扩增内标(IAC,Internal amplification control)的用于食品中猪肉和鸡肉成分鉴别的 Taqman 探针实时荧光 PCR 检测方法,结果显示含有扩增内标的 Taqman 探针实时荧光 PCR 体系能有效地进行食品中猪肉和鸡肉成分的快速检测,非目标物种在 40 个循环内均无出现扩增,检出限均为 0.5 ng DNA;该体系对鲜肉和熟肉来源的 DNA 模板检测无显著差异;对市售食品样本的鉴别验证了方法的实用价值。
本实验中,我们把多重PCR和实时荧光PCR结合起来,以猪的细胞核基因βactin 基因(beta actin gene),鸡的细胞核基因转化生长因子基因(transforming growth factor gene)和鸭的白细胞介素2 mRNA基因(interleukin2 mRNA gene)为靶序列,建立了用于鉴别血旺中猪鸡鸭三种动物血液成分的多重实时荧光PCR方法,可实现对三个物种的同时鉴别。
1 材料与方法
1.1 材料与试剂
1.1.1 材料
新鲜鸡血,鸭血采自农贸市场,新鲜猪血采自屠宰场。驴肉、牛肉、兔肉、鹅肉、鱼、山羊肉、绵羊肉、均购于南京超市,用前均储存在-20℃冰箱。
1.1.2 试剂
酚氯仿方法所用主要试剂:自制STE(0.1mol/LNacl+10mmol/LTrisHCL、pH8.0+1mmol/L EDTA);SDS(20%);Tris饱和酚;Tris饱和酚∶氯仿∶异戊醇(25∶24∶1);氯仿∶异戊醇(24∶1);无水乙醇;NaAc(pH=5.2);70%乙醇;洗脱剂TE。
血液基因组DNA提取试剂盒(DP318) 天根生化科技(北京)有限公司;
血液/细胞/组织基因组DNA提取试剂盒(DP304) 天根生化科技(北京)有限公司;
植物基因组DNA提取试剂盒 天根生化科技(北京)有限公司;
Premix Ex Taq 宝生物工程(大连)有限公司;
引物和探针合成、人工全基因合成 上海辉睿生物科技有限公司完成;
1.2 仪器与设备
MLX206迷你离心机 美国Crystal公司;
TG16WS台式高速离心机 湖南湘仪实验室仪器开发有限公司;
MB102恒温振荡金属浴 杭州博日科技有限公司;
NanoDrop2000微量核酸蛋白分析仪 美国热电公司;
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