利用mirnarace确定生物信息预测的葡萄的vvimir172精确的序列

摘 要：到目前为止，植物中miRNA数以百计的被报道，这些miRNA中很大一部分是用生物信息学方法预测的。然而，与编码蛋白质的基因有起始密码子和终止密码子相比，miRNA分子的两端没有任何特征可以用来确定miRNA成熟体序列，这使生物信息学方法预测miRNA往往不能确定成熟的miRNA在前体中的精确位置。利用miR-RACE生物信息学预测的葡萄的miR172精确序列。本研究构建了葡萄小RNA文库，miRNA的5 RACE、3 RACE和RACE产物的克隆测序。结果表明利用这种有效的新的方法分别验证了葡萄中生物信息学预测的葡萄的miR172精确序列的精确序列。进一步利用RLM-5 RACE来验证miR172对其靶基因的剪切和荧光定量RT-PCR来研究精确序列的表达。这种方法可以克服生物信息学法预测miRNA的的主要缺点不能确定miRNA在前体上的精确序列，可能是miRNA研究非常有用的工具。

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