砀山酥梨hxk基因家族全基因组分析

目录
摘要3
关键词3
Abstract3
Key words3
引言4
1材料与方法5
1.1 HXK基因的数据挖掘5
1.2 HXK基因的系统发育和基因结构5
1.3 HXK基因染色体定位和共线性分析5
1.4 计算HXK基因同义进化替代速率(Ks) 和非同义进化替代速率(Ka) 5
1.5 寻找砀山酥梨HXK基因启动子上游共有/独有顺势启动元件6
1.6 查找砀山酥梨HXK基因家族成员转录组数据6
1.7 试验样品的采集6
1.8 RNA提取和RTPCR 分析6
2实验与分析7
2.1 HXK基因家族成员的鉴定7
2.2 HXK基因的系统发育树7
2.3 HXK基因家族成员的基因结构7
2.4 HXK基因家族成员结构域的分化和结构域的缺失8
2.5 HXK基因家族的共线性关系8
2.6 HXK基因家族成员的进化和复制方式8
2.7 砀山酥梨HXK基因家族顺调控元件和信号调控的作用9
2.8 转录组数据揭示 HXK基因果实发育阶段的功能分化9
2.9 HXK基因在砀山酥梨中的功能分化9
3讨论10
3.1 HXK基因家族的鉴别和基因结构10
3.2 结构域缺失和变异引PbrHXKs功能分化10
3.3 独有顺势启动元件可能引发PbrHXKs成员的特异表达和功能分化10
3.4 基因复制事件引发砀山酥梨HXK基因功能分化11
3.5 砀山酥梨HXK基因家族可靠的候选成员11
致谢13

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