企鹅目谱系时空分析晚中新世气候变化驱动的扩散
：企鹅目（Sphenisciformes）是现存鸟类中非常独立的一个分支，其现存类群不能飞翔而高度适应潜游。分子系统学研究表明企鹅目物种同样属于突胸总目，和潜鸟目关系较近。企鹅目化石种的分布和现存种的分布几乎吻合，都是环南极海域直到近邻的热带地区，故而其现存分布范围可以帮助阐述其起源扩散路径。之前的系统发育分析和分子定年分析在拓扑结构和分歧年代推断方面具有较大差异。本研究采用线粒体和核蛋白序列共计5个分子标记构成的联合数据集分别计算企鹅目现存所有物种的系统发生关系、分歧时间和祖先地理状态，并结合新生代南半球的气候和洋流变化等，解读了晚中新世气候变化驱动下的最显著一次的从南极-亚南极地区向赤道区域的企鹅目物种的扩散。
目录
摘要 1
关键词 1
ABSTRACT 1
KEY WORDS 1
文献综述 2
1.实验材料与方法 4
1.1 分子数据的获取 4
1.2 序列的同源比对 5
1.3 基因数据饱和度检测和模型检测 5
1.4 序列的拼接和数据集的生成 5
1.5 系统发育分析 5
1.5.1 分区贝叶斯推断 5
1.5.2 最大似然法 5
1.6 分歧年代估算 5
1.6.1 化石矫正点的选择 5
1.6.2 贝叶斯宽松分子钟分析 6
1.7 祖先地理状态重建 6
2.结果与分析 6
2.1 同源比对的基本结果统计 7
2.2 进化模型选择和饱和度检测结果 7
2.3 企鹅目鸟类系统发育关系的贝叶斯结果 8
2.4 企鹅目鸟类系统发育关系的似然法结果 9
2.5 企鹅目鸟类分歧时间的推断结果 11
2.6 企鹅目物种祖先状态重建结果 12
3.讨论 14
3.1 不同分区策略在系统发育分析中的表现 14
3.2 企鹅目物种的在晚中新世的扩散 14
致 谢 15
参考文献 16
附 录 18
企鹅目谱系时空分析——晚中新世气候
*好棒文|www.hbsrm.com +Q: #351916072#
变化驱动的扩散
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摘要 1
关键词 1
ABSTRACT 1
KEY WORDS 1
文献综述 2
1.实验材料与方法 4
1.1 分子数据的获取 4
1.2 序列的同源比对 5
1.3 基因数据饱和度检测和模型检测 5
1.4 序列的拼接和数据集的生成 5
1.5 系统发育分析 5
1.5.1 分区贝叶斯推断 5
1.5.2 最大似然法 5
1.6 分歧年代估算 5
1.6.1 化石矫正点的选择 5
1.6.2 贝叶斯宽松分子钟分析 6
1.7 祖先地理状态重建 6
2.结果与分析 6
2.1 同源比对的基本结果统计 7
2.2 进化模型选择和饱和度检测结果 7
2.3 企鹅目鸟类系统发育关系的贝叶斯结果 8
2.4 企鹅目鸟类系统发育关系的似然法结果 9
2.5 企鹅目鸟类分歧时间的推断结果 11
2.6 企鹅目物种祖先状态重建结果 12
3.讨论 14
3.1 不同分区策略在系统发育分析中的表现 14
3.2 企鹅目物种的在晚中新世的扩散 14
致 谢 15
参考文献 16
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