马铃薯转录因子bes1家族的生物信息学马铃薯转录因子bes1家族的生物信息学及转录表达分析【字数：6869】

转录因子BES1家族在植物体内是油菜素甾醇信号通路中重要的元件，直接或与其它转录因子互作调节植物的生长发育。马铃薯是第四大粮食作物，而BES1在马铃薯内的作用机制知之甚少。为了了解马铃薯中该基因家族的相关信息并为后续分子机理解析作铺垫，本研究从马铃薯全基因组上寻找BES1家族成员，进行生物信息学分析，结果发现StBES1家族共有12个转录本，来自9个基因，它们在染色体上分布较为均匀，且可以分为两个亚家族，家族内结构差异较大。进一步通过对基因在不同组织表达量的预测和定量实验的验证，发现两者结果大体符合，其中BES1-2在块茎中表达量较多，可能与块茎形成有关。于此同时，利用定量PCR实验分析基因在不同激素处理下的表达变化，发现IAA对BES1-2促进效果最好，可以达到83倍，ABA对BES1-8促进效果较好，可以达到72倍，BR对BES1家族基因普遍有抑制作用，对BES1-8的抑制作用最显著，表达量是原来的千分之二。本研究为后续StBES1的功能研究打下基础。
目录
摘要1
关键词1
Abstract1
Key words1
引言1
1材料与方法2
1.1 植物材料准备 3
1.2 马铃薯BES1家族基因鉴定 3
1.3 马铃薯BES1家族蛋白鉴定 3
1.4 BES1系统发育树构建与基因结构分析3
1.5 BES1染色体定位3
1.6 转录组数据分析3
1.7 BES1表达分析3
2结果与分析4
2.1 蛋白基本信息4
2.2 系统发育树分析与基因结构特征5
2.3 染色体定位5
2.4 氨基酸序列比对结果6
2.5 马铃薯BES1基因组织表达模式7
2.6 激素处理特异性表达7
3讨论 8
致谢9
参考文献9
马铃薯转录因子BES1家族的生物信息学及转录表达分析
生命基地 周佳欣

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